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影像分析

IHC DAB 分析

免費 IHC DAB 染色定量分析工具。色彩解卷積、DAB 量化、H-Score 計算。無需上傳,瀏覽器運行。

免疫染色影像的陽性定量

範例影像:CMMI(經 scikit-image 提供)

+
拖放 IHC 影像或點擊上傳
拖放或點擊加入 JPEG / PNG / TIFF,可一次多張 · 單檔最大 20MB(TIFF 50MB)
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分離方法

適合蘇木精 + DAB 影像,可把複染與 DAB 分開估計。

DAB 閾值
0.200

預設 0.200;載入影像後會依影像自動估計。

白色參考
I₀ = rgb(255, 255, 255)

若背景偏黃或偏灰,先用吸管校正可讓 OD 與組織偵測更穩定。

使用說明與常見問題

IHC 的 DAB 染色:此工具分析的是什麼

在免疫組織化學(IHC)染色中,DAB 反應會呈現棕色訊號;蘇木精則提供藍色複染。此工具量測染色後影像的像素,不直接測量抗原濃度,也不計算陽性細胞數。請先上傳已裁切的蘇木精 + DAB 視野,檢查染色分離疊圖,再解讀量化結果。

這個版本目前能量到什麼

這個瀏覽器端工具適合已先裁成代表性視野的 蘇木精 + DAB 影像。它會把棕色 DAB 與藍色複染拆開、偵測組織像素,並回報 陽性組織比例、平均 DAB 光學密度、H-Score,以及可選的 整合密度 IntDen / 背景校正總訊號 CTCF 等摘要指標。做 QC 或 CRO 工作、要追蹤同一張對照玻片在不同染色批次的 DAB 強度?先在這裡用相同設定逐張量測,多張影像再用IHC 批次分析一次比較。

  • Ruifrok 解卷積作為主要分離方法,另提供 HSV 作為快速棕色訊號檢查。
  • 閾值式量化:在偵測到的組織遮罩內計算陽性組織比例。
  • 像素層級 H-Score:提供相對分級、固定 OD 與 IHC Profiler 風格三種模式。
  • 即時疊圖預覽:方便你先確認高亮區域是否真的對到要量的棕色訊號。

如何解讀分析結果

組織遮罩決定哪些像素會進入計算。比較數值前,先檢查組織覆蓋範圍與 DAB 疊圖;即使來自同一張切片,裁切範圍、白色參考或閾值改變,也可能使結果不同。

  • 陽性組織 (%)是 DAB 訊號高於閾值的組織像素數,除以偵測到的全部組織像素數。它是面積比例,不是陽性細胞比例。
  • 平均 DAB OD是組織遮罩內所有像素的 DAB 光學密度平均值,也包含未達陽性閾值的像素。
  • H-Score把組織像素分為陰性、弱 (1+)、中 (2+) 與強 (3+),再計算 1 × 弱陽性 % + 2 × 中陽性 % + 3 × 強陽性 %。可能範圍為 0–300;這是像素分級,並非病理醫師依細胞判讀的分數。
  • IntDen 與 CTCF彙整組織遮罩內的 DAB 總訊號。IntDen 加總其中的 DAB OD;CTCF 再扣除依遮罩外像素估計的背景訊號。兩者會受選取面積影響,不應解讀為染色濃度。

計算範例:陽性面積與 H-Score 的差別

假設固定 OD 模式下,一個視野的組織像素有 10% 陰性、50% 弱陽性、30% 中陽性與 10% 強陽性。陽性組織比例是 90%,H-Score 則為 (1 × 50) + (2 × 30) + (3 × 10) = 140。另一個視野若有 90% 弱陽性與 10% 陰性,陽性面積比例相同,H-Score 卻是 90。這些是計算示例,不是實測樣本或診斷切點。

建議使用流程

  1. 先裁切再上傳。 目前版本不提供 ROI 框選,也不適合直接瀏覽整張全切片掃描影像。
  2. 預設先用 Ruifrok。 對標準蘇木精 + DAB 切片,解卷積通常比 HSV 更穩定。
  3. 先看疊圖再看數字。 確認高亮區域真的對應到要量的棕色染色。
  4. 必要時再調白色參考與閾值。 若背景偏黃或偏灰,先用吸管校正再比較數值會更穩定。
  5. 匯出時保留設定。 閾值與分級模式會直接影響結果,建議一起記錄。

結果不如預期時

若疊圖高亮到標註、邊框或空白背景,請重新裁切較乾淨的視野,並檢查組織偵測。背景偏色時,可用白色參考吸管取樣空白區域。出現自動閾值警示時,先檢查疊圖,改試其他閾值方法或手動閾值,再使用陽性比例。若工具提示影像已縮小,請從原圖裁出局部,確認小面積強染區域是否仍可辨識。

比較多個視野時,請維持相同的成像與分析設定,並使用 IHC 批次分析套用同一組參數。CSV 會連同量測值記錄閾值、分級模式、演算法版本與警示。

解讀時請保守

  • 這不是細胞分割。 畫面上的 H-Score 來自組織遮罩內的像素強度分類,不是細胞或細胞核計數。
  • 跨影像比較要靠一致成像條件。 顯微鏡、照明、曝光與染色流程越一致,量化才越可比。
  • 同時確認陽性閾值與分級切點。 相對分級依目前影像中組織像素的最大 DAB 值決定切點。固定 OD 模式可設定弱、中陽性切點,但自動陽性閾值仍會逐張重算。若要共用同一個數值閾值,請手動設定並逐張檢查疊圖。工具會讓分級切點保持順序並高於陽性閾值,因此修改閾值後也要確認畫面顯示的切點。只選固定模式,並不代表影像已具可比性。
  • 定位在研究探索用途。 目前版本不是臨床診斷軟體。

常見問題

影像會上傳到伺服器嗎?

不會。影像留在你的瀏覽器中,色彩分離與量化都在本機完成。

目前支援哪些染色組合?

目前主要針對蘇木精 + DAB。現階段介面沒有提供自訂染色矩陣編輯器。

可以直接分析整張全切片掃描影像嗎?

不建議。請先裁成代表性視野再分析,這樣預覽更容易判讀,瀏覽器也比較不容易卡頓。

「陽性組織 (%)」的分母是什麼?

它的分母是偵測到的組織區域,不是整張上傳畫布的總面積。

版本紀錄

所有工具的版本紀錄集中列於編年史。

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